Фамилия Шипанова — женская форма фамилии Шипанов, и её стоит разбирать через мужской вариант. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Шипан. В русской ономастике суффикс -ан часто указывал на человека по характерному признаку или действию: например, Дерган — от «дёргать», Ломан — от «ломать». В случае с Шипаном корень, скорее всего, связан со словом «шип» — острый выступ, колючка. Прозвище Шипан могли дать человеку с колким, язвительным характером, либо тому, кто занимался изготовлением шипов — например, для колёс или обуви (сапожное дело). В некоторых говорах «шипан» означало ещё и «тот, кто шипит», что тоже отсылает к недоброму, раздражительному нраву.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «шипать» — щипать, обрывать листья. Тогда Шипан — это прозвище работника, занятого на заготовке корма или в огородничестве. В любом случае, фамилия образована по продуктивной модели: основа Шипан + патронимический суффикс -ов, то есть «сын Шипана». Суффикс -ов типичен для центральных и северных регионов России, что указывает на возможное бытование фамилии именно там, хотя точных географических привязок без данных переписей не дать.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) прямого упоминания Шипанова нет, но модель с -ан и корнем «шип» встречается в фамилиях Шипов, Шипачёв, Шипков. Шипанова стоит в этом ряду как более редкий вариант, сохранивший архаичную основу. Социальный контекст: носители фамилии, вероятно, относились к крестьянскому или ремесленному сословию, где прозвища закреплялись за родом по личным качествам или занятию.