Фамилия Шипчин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, стоит отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях чаще всего указывает на принадлежность («чей?» — сын Шипчи). Основа здесь — Шипч-.

Самая вероятная версия ведёт к прозвищу Шипча. В южнорусских и украинских говорах «шипча» или «шипчить» могло означать человека, который «шипит», то есть говорит с присвистом, шепелявит или постоянно выражает недовольство. Такие прозвища по манере речи давали часто. Другая возможность — связь с «шипком» (колючка, заноза). Прозвище Шипча могли дать колкому, язвительному человеку или, наоборот, тому, кто был худым и «колючим» на вид.

Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит украинское слово «шипчина» (шиповник). Тогда прозвище могло относиться к человеку, жившему у зарослей шиповника, или к тому, кто собирал и продавал его плоды.

В пользу первой версии говорит то, что фамилия встречается в основном в Курской, Белгородской и Воронежской областях — на территории исторического расселения южных великороссов, где диалектные формы на -ча были распространены. Словообразовательная модель проста: к основе Шипч- добавили типичный русский суффикс -ин. В украинской среде фамилия могла бы звучать как Шипченко, но русская форма закрепилась именно с -ин.

Сравните с однокоренными фамилиями: Шипков (от «шипок»), Шипов (от «шип»), Шипулин (от «шипуля» — тот, кто шипит). Шипчин стоит особняком из-за редкого суффиксального элемента -ч-, что делает её более узнаваемой и менее распространённой. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не встречается в дворянских или купеческих списках — скорее всего, предки Шипчиных были крестьянами или однодворцами южных губерний.