Фамилия Шипёркина — редкий случай в русском ономастиконе. Она явно образована от прозвища или профессии, но её корень не очевиден. Разберёмся по порядку.

Основа фамилии — «шипёр» или «шипера». Это слово не встречается в современных словарях, но может быть искажением или диалектным вариантом. Самая вероятная версия: «шипёр» — это переделка слова «шкипер» (от нидерл. schipper — капитан, шкипер). В русском языке XVIII–XIX веков, особенно в северных и приморских говорах, «шкипер» часто произносили как «шипер» или «шипёр». Так могли прозвать человека, связанного с морем, речным судоходством или работой на баржах. Фамилия Шипёркина тогда означала бы «жена или дочь шкипера» (через суффикс -ин, указывающий на принадлежность).

Вторая версия, менее правдоподобная, — связь с глаголом «шипеть» или прозвищем «Шип» (шипящий, колючий человек). Но суффикс -ёр нехарактерен для русских прозвищ от глаголов; обычно говорят «Шипунов» или «Шипкин». Поэтому профессиональная версия выглядит убедительнее.

Суффикс -к- в основе «Шипёркин» — уменьшительно-ласкательный или уничижительный (как в фамилиях Семёнкин, Ванькин). То есть исходное прозвище звучало как «Шипёрка» — так могли называть молодого шкипера, его сына или просто человека маленького роста, выполнявшего обязанности шкипера. Фамилия закрепилась в женской форме «Шипёркина», что типично для фамилий на -ин.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России: единичные записи встречаются в Вологодской, Архангельской областях и в Карелии. Это подтверждает морскую версию — именно там активно использовали шкиперов на реках и озёрах.

Сведений о сословной принадлежности носителей Шипёркиных почти нет. Скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия: шкиперы в провинции часто были вольнонаёмными, а не дворянами. Известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано, что неудивительно для редкого ономастикона.

Итог: Шипёркина — фамилия, скорее всего, профессиональная, от слова «шкипер» в диалектном произношении. Она указывает на предка, который водил суда или командовал командой на речном или морском транспорте. Редкость фамилии делает её особенно интересной для тех, кто носит её сегодня.