Фамилия Шистерин — один из тех случаев, когда народная шутка или прозвище закрепились в официальном родовом имени. Её основа — глагол «шистерить» (или «шистовать»), который в русских говорах означал «проказничать, шалить, озорничать». Соответственно, Шистерой в старину называли непоседу, баловника или человека, который любил подшутить над окружающими. Модель образования проста: прозвище Шистера + типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на «сына Шистеры» или «человека из семьи Шистеры».

Фамилия редкая и, судя по географии, имеет северное или северо-восточное происхождение. Наибольшее число носителей фиксируется в Вологодской, Кировской и Архангельской областях. Это не случайно: именно в северных говорах слово «шистерить» было особенно употребительно и сохранялось дольше, чем в центральных регионах. Встречаются также варианты Шистеров и Шистер, но Шистерин — наиболее устоявшаяся форма.

Любопытно, что, несмотря на явно шутливую природу прозвища, фамилия не несла унизительного оттенка. В крестьянской среде прозвища по поведению давались легко и часто переходили в фамилии без негативной окраски. Предки современных Шистериных, скорее всего, были обычными землепашцами или ремесленниками, но в семье сохранилась память о родоначальнике — бойком и веселом человеке.

Однокоренных фамилий немного: можно вспомнить Шистов, Шистаков, но они, как правило, восходят к другим основам (например, «шист» — вид ткани или инструмент). Шистерин стоит особняком — это фамилия-характеристика, которая прямо говорит о темпераменте своего первого носителя. В метрических книгах XIX века она встречается эпизодически, что подтверждает её локальный характер и отсутствие массового распространения за пределами указанных регионов.