Фамилия Шкаробейникова звучит громоздко и редко, поэтому в ней почти всегда угадывают профессиональное прозвище. Самая вероятная версия связывает её с устаревшим словом «шкаробейник» — так в некоторых русских говорах называли скорняка, то есть мастера по выделке шкур и меха. Если убрать суффикс -ник-, получим «шкаробей» — искажённое «скорняк» или «скоро́бей», где корень указывает на «скорняжное дело», обработку кожи. Фамилия образована по модели «профессия + -ник- + -ов»: сначала прозвище Шкаробейник («тот, кто работает со шкурами»), затем отчество Шкаробейников, а женская форма Шкаробейникова закрепилась за дочерью или женой.

Менее убедительная гипотеза выводит основу из глагола «скоробить» — коробить, гнуть, морщить. Тогда Шкаробейник мог получить прозвище за привычку морщиться или за кривой предмет, но такая версия слабее, потому что суффикс -ник- в русских прозвищах чаще указывает на ремесленника, чем на внешность.

Фамилия почти не встречается за пределами России и имеет чёткую региональную привязку. По данным переписей и архивов, носители сосредоточены в центральных и южных областях — Воронежской, Ростовской, а также на Кубани. В этих местах скорняжное дело было распространено, и местные говоры сохраняли «шкаробей» как вариант «скорняка». Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель фамилий, а не украинскую или белорусскую, хотя в XIX веке встречались единичные написания через «о» — Шкоробейников.

С точки зрения словообразования интересно двойное оформление: корень «шкароб-» + суффикс -ей- (как в «грамотей») + -ник- (деятель). Такая цепочка редка: обычно профессия обозначается одним суффиксом («скорняк»), а здесь добавлен дополнительный слой, что делает фамилию диалектно окрашенной и нестандартной. В сословном плане предки Шкаробейниковых, скорее всего, принадлежали к ремесленникам или крестьянам, но точных документальных подтверждений по конкретным родам нет — фамилия не была дворянской и не попала в родословные книги.