Фамилия Шкаринова — женская форма, а мужская, Шкаринов, хранит в основе прозвище Шкаря или Шкара. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с самим словом «шкара», которое в русских говорах имело несколько значений.

Самое вероятное — прозвище по внешности или характеру. В южнорусских и украинских диалектах «шкарой» называли худого, тощего человека, а иногда — сварливого, придирчивого. Второе значение — «облезлая кожа, шкура», что тоже могло стать прозвищем: или для того, кто работает с кожей, или для неряшливого человека. В некоторых местах «шкарить» означало «скоблить, скрести», так что Шкарой могли прозвать уборщика или чистильщика. Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским корнем, где «шкар» означало «кривой, косой»: такое прозвище давали человеку с дефектом зрения или хитрецу.

Фамилия образована по стандартной русской модели: прозвище Шкара + суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Шкарин сын»). То есть Шкаринов — это потомок человека по прозвищу Шкара. Окончание -ов в мужской форме появилось позже, под влиянием более массовой модели, хотя форма Шкарин была бы исторически правильнее. Такая замена — не редкость: фамилии на -ин нередко «подравнивали» под -ов, и наоборот.

Географически фамилия тяготеет к югу России — к Курской, Воронежской, Ростовской областям, а также к Украине. Это подтверждает диалектную основу. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, один род дал начало всем носителям.

В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на дворянское или церковное происхождение, Шкаринов — фамилия крестьянская или мещанская, возникшая в среде, где прозвища давали по приметным чертам. Никакой связи с «школой» (от лат. schola) здесь нет — это ложная ассоциация, которая возникает у носителей фамилии.