Фамилия Шкердова — женская форма, мужская — Шкердов. В русской традиции такие фамилии чаще всего отчественные, то есть образованы от прозвища или имени отца. Основа здесь — «шкерда» или «шкерд». Слово не общеупотребительное, и именно это делает фамилию интересной для разбора.

Самый вероятный источник — прозвище, связанное с профессиональной или бытовой деятельностью. В южнорусских и украинских говорах «шкерда» или «шкерть» — это отходы, остатки, особенно при обработке кожи или сала. Отсюда глагол «шкерить» — снимать шкуру, потрошить, чистить рыбу. Предок-носитель такого прозвища мог быть кожевником, живодёром или рыбаком, занимавшимся разделкой. Прозвище давали не по фамилии, а по занятию — «Шкерда» означало «тот, кто шкерит».

Вторая, менее вероятная версия — диалектное «шкерда» в значении «щербина, зазубрина» или «скряга». Но связь с обработкой кожи и рыбы подтверждается устойчивостью этой лексики в промысловых регионах — на Дону, Кубани, в низовьях Волги. Фамилия Шкердов/Шкердова могла закрепиться именно там, где рыбный или кожевенный промысел был основным.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ на твёрдый согласный. В отличие от фамилий на -ин, которые идут от основ на -а/-я, здесь исходное слово «шкерд» (с отпадением конечного -а) или «шкерда» с последующим усечением. В любом случае, перед нами фамилия, прямо указывающая на ремесло — грубое, но необходимое в старом быту.

Однокоренные фамилии — Шкерин, Шкердин, Шкердов — встречаются редко, что говорит о локальном характере прозвища. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта группа не описана подробно из-за малочисленности, но диалектные данные не оставляют сомнений: Шкердова — фамилия человека, чей предок занимался разделкой или обработкой сырья животного происхождения.