Фамилия Школьникова образовалась от прозвища Школьник. Так часто звали бывших кантонистов, то есть сыновей солдат и военных поселян, обязанных в качестве крепостных обучаться в особой военной школе. Согласно другой, менее вероятной гипотезе, фамилия Школьник имеет еврейское происхождение и является вариантом фамилии Шульман. На идише слово «sul» означает, как школу, так и храм (синагогу). Однако в русском переводе фамилии нашло отражение лишь первое значение слова sul. Однако нельзя исключить, что основатель рода Школьниковых действительно имел отношение к школе: например, он мог быть учеником земской или церковно-приходской школы. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Школьник, со временем получил фамилию Школьникова.