Фамилия Шкребета звучит необычно для русского уха, и это не случайно: её основа связана с украинским и белорусским диалектным словом «шкребти» — скрести, царапать, чесать. В отличие от более привычных русских фамилий на -ов или -ин, здесь мы видим суффикс -ета, который в восточнославянских говорах часто придавал слову значение «тот, кто постоянно или усердно занимается названным действием». Таким образом, прозвище Шкребета могли дать человеку, который непрестанно скрёб, драл или чистил что-то — возможно, кожу при выделке, пол в доме или даже струну на музыкальном инструменте.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в ономастике, — связь с диалектным «шкребет» (болезнь, чесотка). В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком с характерной привычкой чесаться или за тем, кто лечил такую хворь. Однако первая трактовка, опирающаяся на глагол, поддерживается моделью образования фамилий от названий ремесленных действий: ср. Скребец, Шкряба, Шкребень.

Географически фамилия Шкребета наиболее плотно сконцентрирована на западе Украины и в южных регионах Беларуси, что подтверждает её западнорусские корни. В центральной России она встречается редко, и это отличает её от фамилий, образованных от тех же корней, но с иными суффиксами — например, Шкребов или Шкребнев. Социально носители прозвища скорее всего относились к крестьянскому или ремесленному сословию: кожевники, портные, плотники — те, чья работа требовала постоянного скобления, зачистки или выравнивания поверхности.

Ударение в фамилии обычно падает на последний слог — Шкребета, что типично для украинских фамилий на -ета. Встречается и вариант с ударением на второй слог, но он менее распространён и может указывать на белорусское влияние.