Фамилия Шкурнова — женская форма от мужской Шкурнов, но в быту её обычно воспринимают как исходную, поскольку носительниц больше. В основе лежит прозвище Шкурный или Шкурной. В русских говорах «шкурный» означало либо человека, связанного с кожевенным делом (шкуры, выделка кожи), либо, в переносном смысле, — расчётливого, жадного, «шкурника», то есть того, кто думает только о своей выгоде. Слово «шкура» в просторечии имело и уничижительный оттенок — «плохой, подлый человек», но при образовании фамилий негативная окраска часто стиралась.

Суффикс -ов- указывает на типичную модель русских фамилий: сначала было отчество или прозвище отца — Шкурный, затем его дети стали Шкурновыми. Такая модель преобладает в центральных и северных областях России. Встречается и вариант Шкурнов с ударением на второй слог, но чаще ударение падает на первый: Шкурнов, Шкурнова.

Интересно, что фамилия могла возникнуть не напрямую от ремесла, а от географического названия. В России есть несколько деревень с названием Шкурново (например, в Костромской и Нижегородской областях). Выходец из такой деревни получал прозвище Шкурнов, которое затем закреплялось как фамилия. В этом случае изначальный смысл — не «кожевник», а «житель Шкурнова».

В словаре Б. О. Унбегауна «Русские фамилии» подобные примеры разбираются в разделе фамилий от прозвищ, связанных с ремеслом и торговлей. Прямого упоминания Шкурнова там нет, но модель типична: Швецов, Скорняков, Кожевников — и Шкурнов стоит в том же ряду, хотя и с более бытовым, не столь профессиональным оттенком.