Фамилия Шлаканев — редкая, и её разговорная, почти грубоватая основа сразу бросается в глаза. В отличие от большинства фамилий, образованных от церковных имён, эта явно происходит от прозвища. Суффикс -ев указывает на притяжательное значение «чей?»: Шлаканев — сын или потомок человека по прозвищу Шлакан.

Само прозвище Шлакан — это диалектная форма слова «шлак». В русских говорах «шлаком» называли не только металлургические отходы, но и, в переносном смысле, нечто никчёмное, дрянное, а также сварливого, вздорного человека. В некоторых областях «шлакать» означало «хлебать», «пить с шумом», что тоже могло закрепиться в прозвище.

Слово «шлак» пришло в русский язык из немецкого (Schlacke) через горное дело и металлургию. Поэтому наиболее вероятная версия — профессиональное прозвище. Шлаканом могли прозвать работника на заводе, который имел дело с отходами плавки, или человека, жившего неподалёку от шлаковых отвалов. Такая фамилия могла возникнуть на Урале, в Сибири или в промышленных районах центральной России, где в XVIII–XIX веках активно развивалась металлургия.

Менее правдоподобна, но всё же возможна связь с тюркскими корнями, где «шлак» могло быть искажением какого-либо личного имени или прозвища. Однако для фамилии Шлаканев, учитывая её прозрачную славянскую словообразовательную модель, тюркская версия выглядит натянутой.

Встречается вариант написания через «о» — Шлаканов, но форма на -ев (Шлаканев) грамматически правильнее, если исходное прозвище оканчивалось на твёрдый согласный (Шлакан). Сегодня фамилия крайне редка, и её носители, скорее всего, потомки тех самых заводских мастеровых или крестьян, получивших прозвище за характер, манеру питья или профессию.