Фамилия Шлякота — пример прозвища, перешедшего в фамилию, причем прозвища не самого лестного. В ее основе лежит западнорусское или украинское слово «шляк», означающее нечто негодное, дрянь, а также неаккуратного, неряшливого человека. Глагол «шляти» (ср. «шлятися») и производное «шляк» могли относиться к бродяге, шатуну, тому, кто «шляется» без дела. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил это прозвище за неряшливый вид или беспутный образ жизни.

Словообразовательная модель здесь необычна для русских фамилий. Суффикс -ота в белорусском и украинском языках образует отвлеченные существительные со значением качества или состояния (ср. «шляхта» — знать, но здесь другая семантика). В фамилии Шлякота этот суффикс застыл, превратив прозвище в фамилию. Это не типичная русская модель на -ов/-ин, а скорее южно- или западнорусская, где фамилии нередко оканчиваются на -а, -о и не склоняются по падежам как прилагательные. Встречается также вариант Шлякота с ударением на второй слог, что может указывать на польское или белорусское происхождение (от «szlachetny» — благородный, но это маловероятно из-за явной негативной окраски корня).

Географически фамилия привязана к бывшим землям Речи Посполитой: Беларуси, Украине, западным областям России (Смоленщина, Брянщина). Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища. В некоторых говорах «шляк» могло означать также «плохая дорога» или «слякоть», и тогда прозвище могло закрепиться за человеком, жившим на разбитой дороге или в болотистой местности. Но наиболее прямое объяснение — через характеристику человека: неряха, разгильдяй, бродяга.

Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли дать как крестьянину, так и мещанину. Дворянских корней у Шлякоты не прослеживается, хотя в польской шляхте встречались фамилии с похожим звучанием, но с другим корнем (например, Шляхтич). Вариант написания с двумя «т» (Шлякотта) — результат позднейшего искажения или попытки «облагородить» фамилию, но исторически верна форма с одной «т».