Фамилия Шматухина — женская форма мужской фамилии Шматухин, которая образована по типичной для русских фамилий модели: от прозвища или имени при помощи суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Шматухин буквально значит «сын Шматухи» или «человек из рода Шматухи».

Основа фамилии — прозвище Шматуха. Его корень, скорее всего, связан с глаголом «шма́тать» или «шмо́тать». В русских говорах эти слова означали «рвать, трепать, мять (особенно лён, шерсть)», а также «бить, колотить» или «ходить в рваной одежде». Отсюда же идёт слово «шмотьё» — ветхая, рваная одежда. Соответственно, Шматухой могли прозвать человека, который занимался трепанием льна или шерсти (ремесленника), либо неряшливого, небрежно одетого человека. Вторая версия менее вероятна, но возможна: прозвище могло быть связано с диалектным «шмат» — кусок, ломоть (например, хлеба). Тогда Шматухой назвали бы человека плотного телосложения или любителя поесть.

Фамилия Шматухин — редкая. Она почти не встречается в центральных и северных областях России, где преобладают фамилии на -ов/-ев. Её основной ареал — южнорусские и украинские земли (Курская, Воронежская области, восток Украины), где суффикс -ин в фамилиях от прозвищ на -а/-я встречается чаще, чем в других регионах. Эта региональная привязка — одна из ключевых деталей: носители фамилии Шматухин/Шматухина с большой вероятностью происходят из крестьянского сословия юга России, где лён и конопля были распространёнными культурами, а их обработка — обычным промыслом.

С точки зрения этимологии, фамилия стоит в ряду однокоренных: Шматов, Шматовкин, Шматков. Но её уникальность — именно в суффиксе -ух- (-уха), который в русских прозвищах часто носил экспрессивный, грубоватый оттенок (сравните: Грязнуха, Вертуха, Толстуха). Это указывает на то, что прозвище Шматуха было не просто профессиональным, а скорее насмешливым или бытовым — так могли окликнуть человека в деревне за его манеру одеваться или за работу, оставляющую следы на одежде.