Фамилия Шопырин образована по модели, характерной для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей сын?»), а основа — Шопыря. В русской ономастике фамилии на -ин обычно происходят от основ, оканчивающихся на -а или -я, и Шопырин — не исключение. Исходным словом стало прозвище или нецерковное имя Шопыря.

Самое правдоподобное объяснение корня «шопыр» связано с диалектным глаголом «шопырить» или существительным «шопырь». В некоторых русских говорах, особенно на юге и в центральных областях, «шопырить» означало «ерошить, взлохмачивать, торчать в разные стороны». Соответственно, Шопырей могли прозвать человека с растрёпанными волосами, взъерошенного, непослушного, либо того, кто носил одежду небрежно. Это прозвище — яркое, бытовое, из разряда тех, что давали по внешнему признаку или манере поведения.

Вторая, менее распространённая версия связывает «шопырь» с названием инструмента или приспособления. В диалектах встречается слово «шопыр» — палка, кол, или, в некоторых местах, черенок для косы. Если так, то прозвище могло закрепиться за ремесленником, изготавливавшим такие вещи, или за человеком, который постоянно ходил с палкой-посохом. Однако эта гипотеза слабее, так как фиксаций такого значения в словарях меньше, и оно более узкое локально.

Фамилия Шопырин — редкая, её нет в массовых списках распространённых русских фамилий. Она почти не встречается за пределами России и сосредоточена, скорее всего, в нескольких регионах. Можно предположить, что её носители — потомки крестьян или посадских людей из центральной или южной части Русского государства, где бытовал соответствующий диалект. Сословно фамилия однозначно недворянская: суффикс -ин в сочетании с прозвищной основой — типичный признак крестьянской или мещанской среды.

Сравните с однокоренными фамилиями: Шопырев (с суффиксом -ев, если основа на согласный) или Шопырёв — они ещё более редки, но подтверждают, что корень «шопыр» существовал в антропонимиконе. Фамилия Шопырин не имеет отношения к иностранным языкам или тюркским заимствованиям — это чисто русское образование на основе местного говора.