Фамилия Шапырин в своей основе, вероятнее всего, содержит прозвище или нецерковное имя Шапыра. В русских говорах слово «шапыра» имело несколько значений, и чтобы понять, какое из них стало корнем фамилии, нужно присмотреться к географии и словообразованию.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Шапырин, то есть сын или потомок Шапыры. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где отчества на -ин образовывались от основ на -а, -я. Сама основа «шапыр-» вызывает интерес. В диалектах «шапыра» — это не только «шалун» или «ерник», но и человек с неопрятной, взлохмаченной головой (от «шапка» в переносном смысле — «волосы»). В некоторых регионах так называли медлительного, нерасторопного человека.

Есть и другая версия, менее очевидная, но заслуживающая внимания. В ономастических работах А. В. Суперанской отмечается, что фамилии с корнем «шап-» могли относиться к людям, носившим характерный головной убор или торговавшим шапками. Однако в случае с Шапыриным мы видим не шапку, а именно «шапыру» — слово с уменьшительно-пренебрежительным оттенком. Это скорее прозвище, чем профессиональное именование. Сравните с фамилиями Шапкин, Шапочкин — там прямая связь с предметом, а Шапырин — с личной характеристикой человека.

Спорной версией можно считать связь с тюркским «шапыр» (быстрый, проворный), но для русского прозвища это маловероятно: фамилия не имеет характерных тюркских суффиксов и бытует преимущественно в регионах с исконно русским населением, например, в Нижегородской и Костромской областях.

Таким образом, ваш предок Шапыра — это, скорее всего, человек, которого в деревне прозвали за внешность или поведение: либо непоседа, либо, наоборот, лохматый и нерасторопный. Фамилия фиксируется в письменных источниках с XVII века, но массово распространилась после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам глав семей.