Фамилия Шовгенова образована от имени Шовген, которое в переводе на русский язык означает «христианский священник». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Шовгеновых можно лишь на основании генеалогических исследований.