Фамилия Шовканов, вероятно, восходит к восточному имени Шовкан, которое предположительно восходит к тюркскому корню «шовкин» — «шум, гром, рёв». Возможно, Шовканом назвали крикливого ребёнка. Однако нельзя исключать, что фамилия Шовканов — фонетический вариант славянской фамилии Щелканов, образованной от прозвища Щелкан. В старину щелканом называли грубияна, драчуна, буяна или пустослова.