Фамилия Шперун — редкая, но прозрачная по происхождению. Её основа — диалектное или профессиональное прозвище, связанное с польским или западноукраинским словом «szperać» — «искать», «рыться», «шарить». В польских говорах «szperun» — это тот, кто ищет, разбирает, перебирает, копается. В украинском языке есть похожий глагол «шперати» с тем же значением. Таким образом, Шперун — это прозвище для дотошного, въедливого человека, который не успокаивается, пока не докопается до сути. В некоторых говорах так могли назвать и человека, занимающегося разбором старых вещей, ветоши, утиля — этакого старьёвщика или тряпичника, который «шперает» по сусекам.

Словообразовательная модель фамилии указывает на западнославянское влияние. Суффикс -ун в польском и украинском языках образует названия лиц по действию (ср. польск. «gadun» — говорун, «łajdun» — лентяй). Фамилия Шперун — типичная для польской и западноукраинской ономастики, где такие прозвища на -ун часто переходили в фамилии без дополнительных патронимических суффиксов. В русской традиции фамилия могла бы звучать как Шперунов, но её закрепили в исходной, «голой» форме, что дополнительно указывает на польско-украинские корни носителей.

Географически фамилия встречается в основном на западе Украины (Волынь, Галичина) и в юго-восточной Польше. В России она единична и, скорее всего, занесена переселенцами из этих регионов в XIX–XX веках. Никакого отношения к немецкому «шперен» (запирать) или еврейским фамилиям фамилия не имеет — это чисто славянское прозвище по характеру или занятию.

Учитывая редкий суффикс и отсутствие патронимического окончания, фамилия Шперун — хороший пример того, как западные славянские модели словообразования проникли в общерусский фамильный фонд, сохранив свою первоначальную форму. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они происходят из западноукраинских или польских крестьян или мещан, а родоначальник получил прозвище за привычку дотошно разбираться в мелочах или за ремесло, связанное с переборкой и поиском.