Фамилия Шпыгарева — женская форма фамилии Шпыгарев, которая образована от прозвища Шпыгарь. Это редкий случай, когда основа фамилии неочевидна, а её разбор требует обращения к диалектной лексике южнорусских и украинских говоров.

В основе фамилии лежит слово «шпыгарь» — так в некоторых регионах называли человека, который шпыгает, то есть колет, тычет или язвительно высмеивает. Наиболее вероятное происхождение — от глагола «шпыгать» (колоть, жалить, а в переносном смысле — донимать насмешками). Соответственно, Шпыгарь — это прозвище либо острослова, любителя колких шуток, либо, что правдоподобнее, человека, занимавшегося конкретным ремеслом: например, изготовлением или заточкой колющих инструментов (шил, игл, спиц). В некоторых говорах «шпыгарь» также могло означать бродягу или проныру, но эта версия менее обеспечена источниками.

Суффикс -ев в фамилии Шпыгарев указывает на принадлежность: «сын Шпыгаря». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -арь, -ярь (ср. Пономарёв, Звонарёв). Ударение в исходном прозвище, скорее всего, падало на последний слог — Шпыга́рь, поэтому в фамилии оно сместилось на суффикс: Шпыга́рев.

Географически фамилия Шпыгарева встречается преимущественно в южных областях России — в Курской, Белгородской, Воронежской, а также на востоке Украины. Это согласуется с ареалом бытования слова «шпыгать»: оно фиксируется в словаре В. И. Даля как южное и западное. Встречается и вариант написания через «и» — Шпигарев, что отражает диалектное произношение (смягчение или редукцию гласного).

Сословная принадлежность носителей фамилии, судя по архивным данным за XVIII–XIX века, была разнородной: Шпыгаревы записаны и среди однодворцев (потомков служилых людей «по прибору»), и среди мещан, и изредка — среди крестьян. Это подтверждает, что прозвище не было жёстко привязано к одному социальному слою.