Фамилия Штыря — редкий случай, когда прозвище застыло в родительном падеже единственного числа. Если большинство русских фамилий образуется с помощью суффиксов принадлежности (-ов, -ин), то Штыря стоит в том же ряду, что и фамилии Беда, Ветрова, Голова. Такая модель встречается в южнорусских и украинских говорах, где человека называли по яркому признаку в форме «чей?» — Штыря, то есть «сын (или человек) Штыря».

Основа фамилии — прозвище Штырь. В русских диалектах у этого слова несколько значений. Самое прямое — металлический стержень, колышек, которым закрепляют что-то. Но в переносном смысле «штырём» называли высокого, худого и нескладного человека — длинного, как палка. В некоторых регионах слово имело ироничный оттенок: так могли прозвать задиру или того, кто постоянно «тычется» в чужие дела, то есть назойливого человека.

Версия о происхождении от профессионального прозвища тоже имеет право на существование. Штырём в плотницком деле называли деревянный гвоздь или шип, которым скрепляли детали. Мастера, который делал такие крепления, могли прозвать Штырём, а его потомков — Штыря. Однако в этом случае фамилия скорее закрепилась бы в форме Штырев (по сыну мастера), а форма Штыря указывает на прозвище, которое стало родовым именем напрямую.

С географией фамилии всё неоднозначно. Она не привязана к какой-то одной области — встречается и в центральных регионах России, и на юге, но везде крайне редко. Скорее всего, это свидетельство того, что прозвище возникало спонтанно в разных местах независимо друг от друга.

Однокоренных фамилий у Штыри немного: Штырёв, Штыркин, Штырков. Все они образованы от того же корня, но по стандартной суффиксальной модели. Штыря же сохранила архаичную грамматическую форму, что делает её особенно интересной для ономастики: перед нами не просто фамилия, а застывшее прозвище, которое так и не переделали в более привычный вариант.