Фамилия Шубаев образована от диалектного варианта арабского имени Шабай — Шубай, которое переводится как «юноша, юнец». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну всегда оставаться молодым и жизнерадостным. Менее вероятно, что в основе фамилии Шубаев лежит прозвище Шубай, которое восходит к нарицательному «шуба» - «верхняя одежда из меха, покрывающая всё тело». Можно предположить, что Шубаем прозвали мастера по пошиву шуб.