Фамилия Шубаева образована от диалектного варианта арабского имени Шабай — Шубай, которое переводится как «юноша, юнец». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну всегда оставаться молодым и жизнерадостным. Менее вероятно, что в основе фамилии Шубаева лежит прозвище Шубай, которое восходит к нарицательному «шуба» - «верхняя одежда из меха, покрывающая всё тело». Можно предположить, что Шубаем прозвали мастера по пошиву шуб. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Шубаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.