Фамилия Шубалий — редкий пример, где основа ясна, а суффикс заставляет задуматься. Корень здесь, скорее всего, «шуб-», от слова «шуба». Но если большинство «шубных» фамилий (Шубин, Шубников, Шубодеров) прямо указывают на ремесло или предмет одежды, то Шубалий стоит особняком из-за окончания «-ий».

Форма Шубалий — это украинская или белорусская модель фамилии, где суффикс «-ий» выполняет ту же роль, что русское «-ов» или «-ин». Он превращает прозвище в прилагательное: «чей?» — Шубалий, то есть «принадлежащий человеку по прозвищу Шубал(ь)». Само прозвище Шубаль могло возникнуть от слова «шуба» в значении «богатая, тёплая одежда», но с оттенком насмешки — так могли назвать человека, который носил шубу не по погоде, хвастался ею или, наоборот, был бедняком, но мечтал о такой вещи. В юго-западных говорах «шубаль» иногда означало «меховая безрукавка», что тоже могло стать основой для прозвища.

Есть и вторая версия, менее очевидная: фамилия могла произойти от личного имени Шубал — производной формы от Шуба (сравни с именами Шуба, Шубака, которые встречались в древнерусских грамотах). В этом случае Шубалий — патроним, то есть «сын Шубала». Однако в исторических источниках имя Шубал встречается крайне редко, так что прозвищное происхождение правдоподобнее.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам: чаще всего Шубалии встречаются на Украине, в Беларуси и в приграничных областях России (Брянская, Смоленская). Сословного барьера у фамилии не было — её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. Единственное, что роднит всех Шубалиев, — это связь с ремеслом скорняка или просто с бытовой деталью: шуба была дорогой вещью, и прозвище, данное по ней, всегда было заметным.

В написании фамилия устойчива: вариант Шубалий встречается чаще, чем Шубалей или Шубалый. Это подсказывает, что ударение падает на последний слог — Шубали́й, что характерно для украинской акцентной нормы.