Фамилия Шукарева — женская форма от Шукарев, и её разумнее анализировать именно через мужской вариант. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Шукарь. В русской ономастике суффикс -арь часто указывал на род занятий: бондарь, псарь, звонарь. Шукарь, скорее всего, означало человека, который ловит щук, то есть рыбака, специализирующегося на этой хищной рыбе. В говорах слово «щукарь» (с ударением на втором слоге) действительно фиксировали как «рыбак, промышляющий щук» или «любитель щучьей ухи».

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: к основе на -арь прибавили суффикс -ев (Шукарь → Шукарев). Вариант написания через «у» (а не через «ю») — Шукарев — исторически нормален: в старых документах и диалектах «щука» могла звучать как «шука», а «щукарь» — как «шукарь». Это не ошибка, а живое произношение.

Географически фамилия Шукарев (и Шукарева) встречается не повсеместно, а тяготеет к северным и центральным губерниям России: Вологодской, Костромской, Ярославской, а также к Поволжью. В этих областях рыболовство было одним из основных промыслов, и прозвище по рыбе — не редкость. Сравните однокоренные фамилии Щукин, Щукарев, Щукарёв — все они восходят к тому же образу, но Шукарев стоит чуть особняком из-за диалектного смягчения.

Есть и более редкая, но возможная версия: прозвище Шукарь могли дать не за ловлю щук, а за внешнее сходство — вытянутое лицо, узкие глаза или «щучью» хватку. Однако первая версия, ремесленная, правдоподобнее: в крестьянской среде прозвища по занятию были просты и очевидны. Сословно фамилия Шукарева — почти наверняка крестьянская или мещанская, без дворянских корней.