Фамилия Шулигины образована от прозвища или нецерковного имени Шулига. В основе лежит древнерусское слово «шульга» — «левша». Так на Руси называли не только человека, владеющего левой рукой лучше правой, но и того, кто делал всё не так, как принято: не в лад, наособицу, с изъяном. В некоторых говорах «шульгой» звали неловкого или криводушного человека. Фамилия закрепилась в северных и центральных областях России: в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях, а также в Сибири, куда её занесли переселенцы.

Суффикс -ин указывает на типичную модель русских фамилий от основ на -а/-я: Шулига → Шулигин → Шулигины. Это «чей?» — сын Шулиги, потомок человека с таким прозвищем. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются у потомков по мужской линии от имён на твёрдый согласный, -ин в данном случае подчёркивает именно прозвищную природу основы.

Интересно, что слово «шульга» имеет параллели в других славянских языках: в польском szulga — тоже «левша», а в чешском šulit' — «косить, кривить». Это позволяет предположить, что корень общеславянский, хотя в русском языке он практически исчез из активного употребления, сохранившись только в фамилиях и диалектах. Прозвище могло быть дано не только за физическую особенность, но и за манеру поведения: например, человек, который «шульжит» — то есть уклоняется от прямого ответа или делает всё вкривь.

Сословно Шулигины не были привязаны к одному кругу. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются и крестьяне Шулигины из новгородских пятин, и посадские люди, и даже мелкие служилые. Фамилия не аристократическая, но и не редкая — она бытовала в разных слоях, что подтверждается разбросом по губерниям. Сейчас носители фамилии живут по всей России, но чаще всего — в Кировской, Вологодской и Свердловской областях, что совпадает с историческими путями миграции населения с Русского Севера.

Если коротко: Шулигины — потомки того, кого в старину прозвали Левшой. Не в смысле знаменитого тульского мастера, а в прямом, бытовом значении — человека, который отличался от других хотя бы тем, какой рукой держит ложку.