Фамилия Шуршунов образована от прозвища Шуршун. В её основе лежит подражательный глагол «шуршать» — издавать глухой шелестящий звук. Прозвище могли дать человеку с быстрой, лёгкой походкой, который ходил, «шурша» одеждой или обувью, либо тому, кто говорил шепотом, невнятно, «шуршал» речью. В русских говорах слово «шуршун» фиксируется и в значении «сплетник» или «тот, кто сеет смуту» — то есть человек, от которого идёт негромкий, но недобрый шум.

Модель фамилии типична для русского Северо-Запада и Поволжья: основа на твёрдый согласный плюс суффикс -ов. Это указывает на то, что прозвище Шуршун принадлежало главе семьи, а его потомки стали Шуршуновыми. Интересно, что в отличие от более распространённых фамилий на звукоподражательную основу (Шепелев, Шушунов), Шуршунов встречается реже и имеет более узкую географию. По данным переписей XIX века, носители фамилии концентрировались в основном в Вятской и Пермской губерниях, что может говорить о локальном бытовании прозвища именно в тех краях.

Версия о происхождении от тюркского имени Шуршун (с возможным значением «быстрый, резвый») менее вероятна: фамилия не имеет характерных тюркских суффиксов, а её звуковой облик полностью укладывается в восточнославянскую модель прозвищ по действию. Таким образом, предок носителя фамилии Шуршунов, скорее всего, был человеком, которого окружающие запомнили по лёгкой походке, тихой речи или причастности к негромким пересудам.