Фамилия Шушалыкова — женская форма фамилии Шушалыков, и первое, что бросается в глаза, это необычная основа. В отличие от привычных фамилий на -ов/-ев, здесь мы видим суффикс -ыков, который встречается реже и часто указывает на тюркское или диалектное происхождение. Если отбросить окончание, остаётся корень «Шушал-», который напрямую связан с прозвищем Шушал.

Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «шуш» или его производные. В ряде тюркских языков «шуш» означает «тихий», «спокойный» или даже «глухой». Прозвище Шушал могли дать человеку неразговорчивому, молчаливому, либо тому, кто плохо слышал. Другая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным русским глаголом «шушать» — шептать, говорить тихо, что встречается в некоторых говорах Поволжья. В таком случае Шушал — это тот, кто постоянно шепчется или говорит невнятно.

География фамилии тоже подсказывает направление поиска. Шушалыковы — не частая фамилия, но её концентрация заметна в Татарстане, Башкортостане и соседних областях, где веками жили рядом русские и тюркские народы. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: прозвище могло возникнуть в среде татар или башкир, а затем перейти в русскую фамилию через браки или крещение.

Суффикс -ыков (а не -ов или -ев) в русской ономастике часто появляется в фамилиях, образованных от прозвищ с конечным мягким согласным или от основ, заимствованных из других языков. Здесь он играет роль патронимического показателя: Шушалыков — «сын Шушала». Интересно, что в документах XVIII–XIX веков встречается и написание через «а» — Шашалыков, но это, скорее всего, вариант, возникший из-за акающего произношения в южнорусских и средневолжских говорах.

Сословная принадлежность предков Шушалыковых, судя по отсутствию громких дворянских родов с такой фамилией, была крестьянской или мещанской. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века Шушалыковы фигурируют как государственные крестьяне или однодворцы, что типично для фамилий, возникших из прозвищ, а не из имени или профессии.