Фамилия Шушукин образована от прозвища Шушука, в основе которого лежит глагол «шушукать». Даля это слово трактуется как «говорить шепотом, шептать». Вполне вероятно, что это прозвище указывало на особенности речи предка. По другой версии, прозвище Шушука этимологически связано с глаголом «шушукать» в значении «говорить по секрету». В этом случае такое прозвище мог получить скрытный, недоверчивый, осторожный человек. Кроме того, в некоторых говорах «шушукать» означало «шуметь, шелестеть». Поэтому не исключено, что основой для прозвища Шушука стало именно это значение данного глагола. Следовательно, Шушукой могли называть крикливого, капризного ребенка. Так и прозвище Шушука закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шушукин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шушука, со временем получил фамилию Шушукин.