Фамилия Шуйкова — женская форма фамилии Шуйков, и её происхождение напрямую связано с вопросом: был ли предок родом из города Шуя или получил прозвище от слова «шуй»? Разберёмся по порядку.

Основа фамилии — «шуйк-». Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Шуйков — сын Шуйка. Само же слово «Шуйко» — это либо прозвище, либо указание на место жительства. В русских говорах «шуй» означало «левый», отсюда «шуйца» — левая рука. Левшу или человека, который всё делал левой рукой, в старину могли прозвать Шуйком. Такое прозвище было нередким, и оно легко превращалось в фамилию.

Вторая, более известная версия — топонимическая. Город Шуя в Ивановской области дал начало фамилиям Шуйский и Шуйков. Если человек переезжал из Шуи в другую местность, его могли записать как «Шуянин» или «Шуйков». Однако фамилия Шуйков встречается не только в центральной России, но и на Урале, в Сибири, что говорит о более широком распространении прозвищного варианта.

Обратите внимание на суффикс «-к-» в основе. В отличие от фамилии Шуйский, где суффикс «-ск-» типичен для княжеских или дворянских родов (князья Шуйские), фамилия Шуйков образована по народной модели. Суффикс «-к-» в прозвищах часто придавал оттенок уменьшительности или просто разговорной формы: Шуйко — это не «выходец из Шуи», а скорее человек, которого так окрестили за особенность.

Таким образом, наиболее вероятно, что первый носитель фамилии Шуйков — это человек по прозвищу Шуйко, то есть левша. Менее вероятно, но не исключено, что его предки жили в городе Шуя. В любом случае, фамилия имеет древние корни и связана с живым русским языком, а не с книжной традицией.