Фамилия Шварцер имеет родственную этимологию с немецким прилагательным schwarz, которое в переводе на русский язык означает «черный». Вероятно, фамилия отражала особенности внешности ее основателя - темные глаза, черные волосы, смуглая кожа. Однако не исключено, что фамилия Шварцер могла быть связана и с родом деятельности предка (например, трубочист или чернорабочий).