Фамилия Швейкова — женская форма фамилии Швейков, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. В основе фамилии лежит прозвище или профессиональное именование Швейк. Самая очевидная версия — связь с немецким словом Schweik или Schweiker, что в южнонемецких диалектах могло означать «молчаливый», «тихий» или, напротив, «упрямец» (ср. баварское schweigen — молчать). Однако в чешском и словацком контексте фамилия Швейк (Švejk) известна в первую очередь благодаря литературному герою Ярослава Гашека — бравому солдату, имя которого стало нарицательным. Но в реальной ономастике чешская фамилия Švejk восходит к древневерхненемецкому Sweik или Sweiko, уменьшительной форме от имени Sweidger (состоящего из корней «свита» и «копьё»).

На русской почве фамилия Швейков (и, соответственно, Швейкова) могла появиться несколькими путями. Первый — через контакты с немцами-колонистами или чехами, переселявшимися в Российскую империю в XVIII–XIX веках. Второй — как прозвище, данное русскому человеку за сходство с персонажем Гашека: весёлый, неунывающий, себе на уме. В этом случае фамилия могла возникнуть уже после выхода книги (1921–1923 годы), что для русских фамилий — случай редкий, но возможный в советское время, когда литературные образы иногда становились источником прозвищ.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: от прозвища или имени Швейк с помощью притяжательного суффикса, отвечающего на вопрос «чей?». Швейкова буквально означает «дочь или жена человека по прозвищу Швейк». В дореволюционных документах фамилия встречается крайне редко, в основном среди мещан и крестьян западных губерний (Смоленская, Могилёвская, Витебская), что подтверждает её возможное польское или белорусское посредничество: в польском языке Szwajk — вариант записи той же немецкой основы.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Швейков стоит в одном ряду с Швейкером, Швейгом, Швайком. Но именно форма Швейкова — самая русифицированная, с полной адаптацией под славянскую патронимическую модель. Сегодня носительницы этой фамилии могут встретиться по всей России, но наибольшая концентрация — в Москве и Санкт-Петербурге, куда в XX веке стекались переселенцы из западных областей.