Фамилия Сибекин образована от прозвища Сибека, которое восходит к нарицательному «сибек». Сибек — это название одного из подразделений башкирского племени Юрмат. Их символическое изображение — семилепестковый цветок курая на гербе и флаге Башкортостана. Таким образом, прозвище Сибека могло указывать на национальную принадлежность родоначальника Сибекиных. Однако, так могли прозвать и русского человека, который своими внешними данными, либо по ведению образа жизни чем-то напоминал сибеков. Менее вероятно, что в основе фамилии лежит греческое имя Себек. Себек — древнеегипетский бог воды и разлива Нила, изображавшийся с головой крокодила; считается, что он отпугивает силы тьмы и является защитником богов и людей. Сопоставлялся с богом земли Гебом, с солнечным божеством Ра в форме Себек-Ра и с Осирисом. Себек почитался главным образом в Файюме, на берегах Меридова озера, в Ком-Омбо (Омбосе), Крокодилополе, а также некоторых других местах, большей частью близких к воде. Культ его был особенно распространен во времена Среднего царства, многие фараоны которого имели резиденции в Файюме и иногда носили имена, производные от имени Себек (например, Себекхотеп или Нефрусебек).