Фамилия Сибекины — редкий пример того, как русская фамилия может уводить вглубь веков и к башкирским степям, и к древнеегипетским культам. В основе фамилии лежит прозвище Сибека, а оно, в свою очередь, восходит к нарицательному «сибек». Так называли одно из подразделений башкирского племени Юрмат. Символ этого подразделения — семилепестковый цветок курая, который сегодня красуется на гербе и флаге Башкортостана. Поэтому первая и самая правдоподобная версия: прозвище Сибека указывало на национальную принадлежность родоначальника. Однако так могли прозвать и русского человека, который внешностью или укладом жизни напоминал окружающим сибеков — например, был выходцем из тех мест или сохранил какие-то южные черты в облике.

Менее вероятна, но всё же любопытна версия, связывающая фамилию с именем Себек. Это древнеегипетский бог воды и разлива Нила, которого изображали с головой крокодила. Считалось, что он отпугивает силы тьмы и защищает богов и людей. Себека сопоставляли с богом земли Гебом, с солнечным божеством Ра (в форме Себек-Ра) и с Осирисом. Культ его был особенно распространён во времена Среднего царства, многие фараоны носили имена, производные от имени Себек, — например, Себекхотеп или Нефрусебек. Почитали его в Файюме, на берегах Меридова озера, в Ком-Омбо и Крокодилополе. Но если присмотреться к словообразованию, эта версия проигрывает: греческое имя Себек в русской среде дало бы скорее формы Себеков или Себекин, а не Сибекин. Фамилия Сибекин образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Сибекин, то есть сын Сибеки. Такая модель характерна для прозвищ, а не для имён святых или божеств, поэтому башкирский след выглядит убедительнее.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на столетия, и письменные источники по такой редкой фамилии скудны. Но сама её структура — прозвище плюс притяжательный суффикс — говорит о том, что предки носителей фамилии жили в среде, где русский язык соседствовал с тюркскими наречиями, вероятно, на юго-восточных рубежах России. Фамилия Сибекины — памятник не столько славянской письменности, сколько живого межэтнического контакта: она могла родиться на стыке культур, где прозвище, данное соседом, становилось семейным именем на века.