Фамилия Симошкин ведет начало от имени Симошка — так на Руси в быту, в кругу семьи и среди соседей, называли человека, носившего крестильное имя Симон. Само это имя пришло из древнееврейского языка и означает «внимающий». Стоит добавить, что среди апостолов был Симон, прозванный Кананитом, а в греческой традиции — Зилотом, то есть «ревнителем», что тоже переводят как «внимающий» или «усердный». Именно от этой народной формы имени, а не от полного церковного, и пошла фамилия: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Симошкин буквально означает «сын Симошки», «тот, кто из рода Симошкиных».

Существует и вторая версия, менее правдоподобная, согласно которой Симошка — это народная форма имени Симеон. Симеон в переводе с того же древнееврейского языка значит «услышанный Богом в молитве». Однако с точки зрения исторической фонетики и словообразования, версия с именем Симон выглядит убедительнее: форма Симошка образована от основы Сим- с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -ошк-, тогда как от Симеона скорее ожидалась бы форма Сёма или Семушка. Поэтому в большинстве ономастических работ фамилию Симошкин связывают именно с Симоном.

Сам тип фамилии — с суффиксом -ин — характерен для центральной России и Поволжья, где такие фамилии складывались в XVI–XVII веках у крестьян и посадских людей. Первым носителем фамилии, скорее всего, был не сам Симошка, а его сын или внук, которого в документах записали как Симошкин сын. Со временем притяжательная форма закрепилась и стала передаваться по наследству уже как фамилия.