Фамилия Синюхины образована от личного прозвища Синюха и относится к распространенному типу русских фамилий на -ин. Такая модель типична для севера России и Поволжья: суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я, в то время как на юге и западе предпочитали -ов/-ев. Поэтому, хотя точное место возникновения фамилии неизвестно, её форма указывает скорее на северное или центральное происхождение.

Скорее всего, прозвище Синюха относится к «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Синюхой в старину называли красильщика: человека, который красил ткани в синий цвет либо выделывал синель — особый вид кручёных нитей. Однако в некоторых говорах глагол «синить» означал «красить ткани вообще, в любой цвет», так что предок Синюхиных мог работать с охрой, сангиной или другими природными красителями, а не только с индиго.

Занятие красильщика было заметным и требовало сноровки: краски готовили из коры, ягод, минералов, и мастер, перепачканный синькой, легко получал уличное прозвище. Не исключено и более простое объяснение — прозвище могли дать человеку с синеватым оттенком лица, например, из-за болезни или особенности внешности. Но профессиональная версия выглядит правдоподобнее: она подкреплена глагольной основой и устойчивой связкой «синить — синель — Синюха».

Наиболее ранняя документация, содержащая фамилию Синюхин, относится к XVII веку. Это время, когда фамилии активно закреплялись у посадских людей и служилых, а ремесленные прозвища часто становились наследственными. Потомок человека по прозвищу Синюха со временем получил фамилию Синюхин, и она закрепилась за его родом.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным и шёл в разных регионах с разной скоростью. В переписных книгах XVII века Синюхины встречаются среди крестьян и посадских, но массовое распространение фамилия получила уже в XVIII–XIX веках, когда её фиксировали в метрических книгах центральных губерний.

Фамилия Синюхины — редкий пример того, как прозвище, связанное с ремеслом, сохранило в себе память о древнем занятии, которое сегодня почти забыто. Сама по себе она — памятник славянской письменности и культуры, но прежде всего — напоминание о конкретном человеке, который когда-то красил ткани и получил за это имя, пережившее столетия.