Фамилия Синюткин происходит от прозвища Синютка, которое в тамбовских и нижегородских говорах связано с глаголом, означающим «полоскать в воде с разведенной синькой, подсинивать», а также «красить ткани в любой цвет». Скорее всего, Синюткой называли мастера-красильщика либо ребенка такого ремесленника. Потомки человека с этим прозвищем со временем закрепили за собой фамилию Синюткин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Синюткин буквально значит «сын Синютки». Такая модель — одна из самых распространенных в русской антропонимии, но основа здесь необычна. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имен (Иванов, Петров) или черт характера, Синюткин отсылает к ремеслу. Это сразу выделяет её из ряда однотипных «патронимических» фамилий и сближает с профессиональными прозвищами вроде Красильников или Синьков.

Слово «синюха», «синька» в народной речи имело и другое значение — так иногда называли человека с синеватым оттенком кожи, например, замёрзшего или бледного. Однако версия о красильщике выглядит правдоподобнее: глагол «синютить» в указанных говорах зафиксирован именно в значении окрашивания ткани. Прозвище Синютка могло закрепиться и за тем, кто постоянно носил вымазанную краской одежду, но и тогда исходная точка — ремесло, а не внешность.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно: фамилии в крестьянской среде формировались долго, вплоть до XIX века, и не всегда фиксировались документально. Но сам факт, что прозвище бытовало в тамбовских и нижегородских землях, позволяет предположить региональную привязку первых носителей — вероятно, это были крестьяне или посадские люди из центральной России, где было развито ткачество и окраска холстов.

В письменных источниках фамилия встречается редко, и известных носителей с громкой исторической биографией среди Синюткиных нет. Зато она хорошо сохранилась как живое напоминание о будничном труде предков — тех, кто сидел над чанами с краской и придавал тканям цвет.