Фамилия Скадин образована от прозвища Скада, и в её основе лежит, скорее всего, литовский глагол skaidyti — «расщеплять; раздроблять». Такое прозвище относилось к «профессиональным» именованиям и указывало на род занятий. Предок Скадиных мог заниматься трепанием льна, конопли или обмолотом зерна: работа, требующая не столько силы, сколько сноровки и точного, «расщепляющего» удара.

Менее правдоподобная гипотеза возводит прозвище к глаголу «скажаться» — «беситься, как волк, собака», «сходить с ума». В этом случае Скада указывала бы на черты характера, причём, по логике этой версии, родители могли дать такое имя в охранном смысле: надеясь иметь умного и спокойного мальчика, называли его наоборот. Но лингвистически этот вариант слабее: переход от «сказиться» к «скада» требует лишних допущений, тогда как литовская основа объясняет форму напрямую.

Сама фамилия построена по стандартной русской модели: к основе Скад- добавлен притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность потомку человека с прозвищем Скада. Такая модель типична для северорусских и новгородских земель, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем в остальной России. Впрочем, точная география бытования фамилии Скадин сегодня размыта, и однозначно привязать её к конкретному региону сложно.

Любопытно, что фамилия осталась редкой и не обросла вариантами вроде Скадов или Скадский. Это говорит о том, что родоначальник, вероятно, жил в небольшой общине, где прозвище закрепилось за одной семьёй и не распространилось по соседним деревням. Словарь Б. Унбегауна не фиксирует эту фамилию, что тоже характерно для локальных, «камерных» именований, не попавших в дворянские родословные или переписи крупных городов.