Фамилия Скакуненко — яркий пример украинской модели образования фамилий на -енко. Этот суффикс, самый распространённый в восточной и центральной Украине, буквально означает «маленький» или «сын»: Скакуненко — «сын Скакуна». В основе лежит прозвище Скакун.

Прозвище Скакун в старину было многозначным. Наиболее вероятная версия — от глагола «скакать». Скакуном могли назвать резвого, непоседливого человека, любителя попрыгать или быстро бегать. Однако слово «скакун» имело и более конкретные значения. В южнорусских и украинских говорах так называли не только лошадь, но и кузнечика, а также плясуна, отплясывающего вприсядку. Поэтому предок-носитель фамилии мог быть либо энергичным танцором, либо обладателем прозвища по сходству с насекомым, либо просто вертлявым парнем.

Встречается и другая, менее очевидная трактовка. В некоторых диалектах «скакун» означало «тот, кто скачет верхом», то есть всадник. Вряд ли это прямое указание на профессию — скорее, на характерное умение или привычку.

Фамилия Скакуненко — типично украинская по ареалу. Она распространена в Полтавской, Черкасской, Киевской областях, а также на юге России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. Встречаются и однокоренные варианты: Скакун, Скакунов, Скакунский, а также более редкие Скакунцев и Скакуненков, которые могли возникнуть при русификации исходной формы.

Таким образом, Скакуненко — это фамилия, которая напрямую говорит о характере или повадках предка. Она не связана с дворянским сословием или знатным родом, а принадлежит к пласту народных прозвищных фамилий, которые давали простым людям в быту.