Фамилия Скиндерите — редкий случай, когда географический и языковой след виден сразу, без глубокого разбора. Это не русская фамилия в привычном понимании, а литовская, причём женского рода. В Литве и соседней Латвии фамилии имеют чёткие окончания, указывающие на пол: мужские заканчиваются на -ас, -ис, -ус (например, Скиндерас, Скиндерис), а женские — на -е, -айтė, -утė, -ите. Окончание -ите (в русской передаче -ите) — один из самых распространённых суффиксов для незамужних женщин в литовской ономастике. То есть Скиндерите — это буквально «дочь или жена Скиндераса» или «Скиндериса».

Основа Скиндер- восходит к литовскому слову skinderis — «топор» или «секира», но в переносном смысле так могли прозвать плотника, дровосека или человека с тяжёлым, «рубящим» характером. Встречается и вариант skinda — «щепка», «стружка», что тоже отсылает к работе с деревом. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, занимался лесным или плотницким делом — рубил лес, тесал брёвна, строил.

На территории бывшей Российской империи, особенно в западных губерниях (Ковенской, Виленской), литовские фамилии часто русифицировали, добавляя окончания -ов, -ев, -ин. Но Скиндерите сохранила исходную форму, потому что либо её носители оставались в Литве после 1918 года, либо фамилия попала в русский язык через документы уже в советское время, когда перевод на русский шёл по принципу транслитерации, а не переделки. Встречается она и сейчас в основном среди литовцев, а также в смешанных семьях, где один из супругов — литовец.

Спорных версий у фамилии почти нет: литовская основа прозрачна, а суффикс однозначно указывает на пол. Единственная путаница может возникнуть у русского читателя, который по привычке попытается выделить в фамилии суффикс -ит- и отыскать корень скинд- в славянских языках — но там его нет. Фамилия Скиндерите — чистый балтийский след, который не переосмысливался в русской среде.