Фамилия Скочиленков — редкая и морфологически сложная. Сразу бросается в глаза необычный формант. Если большинство русских фамилий на -ов/-ев образованы от основ на согласный, а на -ин — от основ на -а/-я, то здесь мы видим суффикс -енков. Это характерная черта восточноукраинских и южнорусских (особенно курско-орловских) фамилий, где -енко (уменьшительный суффикс) обросло великорусским -ов, дав форму Скочиленков. Такая модель указывает на то, что предок был выходцем с территории современной Украины или юга России, где фамилии на -енко особенно распространены.

Основа фамилии — прозвище Скочил(о) или Скочиленко. Глагол «скочить» (скакать, прыгать) в старых говорах имел оттенок резкого, порывистого движения. Прозвище могли дать человеку непоседливому, живому, быстро бегающему или же тому, кто работал на скаковых лошадях — конюху, наезднику. Второй, менее очевидный вариант: в некоторых диалектах «скочила» называли задиру или драчуна — того, кто «вскакивает» в ссору. Учитывая суффикс -енк(о), прозвище было уменьшительно-ласкательным или указывало на молодого человека: Скочиленко — «маленький скакун» или «сын Скочилы».

С точки зрения истории сословий, фамилии с таким построением (основа + -енко + -ов) редко встречаются у дворянства. Скорее всего, Скочиленковы — потомки крестьян, однодворцев или казаков. В документах XIX века подобные фамилии фиксируются в Курской, Воронежской и Харьковской губерниях — как раз на стыке великорусских и малорусских земель, где смешивались две ономастические традиции.

Интересно, что фамилия не даёт однозначного ответа, от какого именно слова пошла основа: от «скакать» или от «скочить» (в значении «спрыгнуть», «соскочить»). В пользу первой версии говорит активный, подвижный характер прозвища. В пользу второй — возможная связь с ремеслом: в некоторых говорах «скочила» называли кузнеца, который работает с «наскоком» — быстрыми ударами молота. Но это уже гипотеза, не подтверждённая в основных ономастических словарях.

В современной России фамилия встречается точечно, чаще всего в Центральном Черноземье и в Москве — куда люди переезжали в XX веке. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, связаны общим предком не далее как в XVIII–XIX веках.