Фамилия Скрипунова хранит память о прозвище дальнего предка — Скрипун. В основе лежит распространённое в старину прозвище, которое давали человеку по характерной особенности поведения или звука. Чаще всего Скрипуном называли того, кто постоянно ныл, жаловался на жизнь или капризничал. Глагол «скрипеть» в переносном смысле значил «ныть, плакаться», и такое прозвище закреплялось за ворчуном или брюзгой.

Существует и другая версия, менее правдоподобная: будто прозвище получил человек со скрипучим, звучным голосом либо тот, кто носил сапоги со скрипом. Эта гипотеза красива, но слаба: слишком уж узкий и случайный признак для устойчивого уличного имени. В народной традиции прозвища чаще отражали поведение или характер, а не случайный звук обуви.

Сама фамилия образована по простой и типичной для русских фамилий модели: к основе Скрипун добавили суффикс -ов, получилась форма притяжательного прилагательного «сын Скрипуна». Со временем эта форма закрепилась как фамилия, а у женщин появился вариант Скрипунова. Такая словообразовательная схема — одна из самых массовых в русской ономастике, её подробно описал Б. Унбегаун в труде о русских фамилиях.

Родственные фамилии — Скрипкин, Скрипцов, Скрипалёв — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Это говорит о том, что прозвище Скрипун и его производные бытовали в разных регионах независимо друг от друга. Где-то говорили «скрипун», где-то «скрипка», но смысл оставался схожим: так могли прозвать и плаксивого ребёнка, и въедливого старика.

Точных сведений о том, в каких губерниях фамилия Скрипунова встречалась чаще всего, в открытых источниках нет. Но по модели образования и по аналогии с однокоренными фамилиями можно предположить, что она возникла в среде крестьян или посадских людей, где прозвища передавались по наследству ещё до закрепления фамилий в XVIII–XIX веках.

Фамилия Скрипунова — это не просто набор букв, а сжатый портрет предка: живой, характерный, возможно, не самый покладистый человек, которого запомнили соседи и родня за его манеру скрипеть — жаловаться или ныть. В этом смысле фамилия честно доносит до нас кусочек бытовой психологии тех времён, когда прозвище было точнее паспорта.