Фамилия Скрысанова — женская форма, мужская — Скрысанов. В её основе лежит прозвище или неканоническое имя Скрысан, которое, скорее всего, образовано от глагола «скрысать» — в старых говорах это значило «грызть, обгрызать, сгрызать». Слово родственно диалектному «крысать» (царапать, скрести, грызть) и, конечно, самому названию животного — крысе. Прозвище Скрысан могли дать человеку с дурной привычкой грызть ногти или семечки, либо тому, кто был въедливым, придирчивым и «грыз» окружающих мелкими упрёками. Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с «крысом» (кротом) — тогда Скрысан мог быть коренастым, невысоким человеком или землекопом, но фонетический переход «крыс» в «скрыс» маловероятен.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ов-, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: Скрысанов буквально — «сын Скрысана». Суффикс -ан- в основе (Скрыс-ан) часто использовался для образования имён-прозвищ от глаголов (ср. Долган, Стукан, Булган).

Географически фамилия редкая и тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где диалектное слово «скрысать» было в ходу. В дореволюционных источниках встречается в Рязанской и Тамбовской губерниях, что косвенно подтверждает крестьянское происхождение: фамилия недворянская, скорее всего, закрепилась за однодворцами или государственными крестьянами. В современной России носители фамилии рассеяны, но заметной концентрации нет ни в одном регионе.

С точки зрения словообразования, фамилия Скрысанова стоит в ряду однокоренных, но более редких вариантов: Скрысаев, Скрысюк, Скрыслёв. Все они восходят к тому же глагольному корню, но различаются суффиксами, что указывает на разные регионы и эпохи закрепления фамилии.