Фамилия Скрыжевский образована по типичной для польской и западнорусской шляхты модели: суффикс -ский указывает на принадлежность к месту. Основа — топоним Скрыжев (Скрыжево). Таких названий в Польше и в западных губерниях Российской империи было несколько, и все они восходят к слову «крыж» — так на западнорусских землях и в польском языке называли крест (от лат. crux, нем. Kreuz). Скрыжев — буквально «место, где стоит крест»: либо придорожная часовня, либо перекрёсток, либо участок, отмеченный крестом на карте или на местности.

Приставка с- в названии — результат стяжения предлога «з» (с) и корня: «з-крыж-ев» — «из-под креста» или «у креста». Со временем начальное з- оглушилось и перешло в с-, а фамилия закрепилась в форме Скрыжевский. В польском языке параллельно существует вариант Skrzyżewski (Скшижевски) — от того же корня, но с иной огласовкой.

Носители фамилии — потомки тех, кто владел или жил в имении Скрыжев. Это типичная «дворянская» фамилия по географическому признаку: в Речи Посполитой такую модель (-ский/-цкий) предпочитала именно шляхта, а не крестьяне. Позже, после разделов Польши, многие Скрыжевские оказались в списках дворянства Волынской, Киевской, Подольской губерний. Встречается фамилия и у православных, и у католиков — граница веры в этом регионе была размытой.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную приставку с- вместо более привычного з-. В написании встречаются варианты Скрыжевский и реже Скрыжевский (с твёрдым знаком — до реформы орфографии). Сходные фамилии — Крыжевский, Крыжановский, Крестовский — все от того же корня «крест», но Скрыжевский выделяется именно этой начальной приставкой, которая указывает на точное местоположение: не просто «крестовый», а «тот, кто с Крыжева».