Фамилия Скунсов — редкий случай, когда основа бросается в глаза, но её происхождение неочевидно. На слух фамилия звучит как отсылка к животному скунсу, но в русской ономастике прозвища по названиям животных обычно давали за внешность или повадки. Однако скунс — зверь не местный, в России он не водился, и простой крестьянин XVII–XVIII века вряд ли мог с ним столкнуться. Значит, либо прозвище пришло из более позднего времени, когда о скунсах узнали из книг, либо корень здесь совсем другой.

Вероятнее всего, основа Скунс — это искажённое или диалектное произношение слова «скунс» в значении «скупой, жадный человек». В некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, слово «скунс» или «скунь» означало скрягу, того, кто «скулит» над каждой копейкой. Связь с глаголом «скулить» (ныть, жаловаться) прослеживается фонетически. Прозвище Скунс мог получить прижимистый или вечно недовольный человек, и уже от него образовалась фамилия по стандартной модели: Скунс + ов = Скунсов (чей? — сын Скунса).

Менее убедительная версия — связь с фамилией Скунсов через польское или украинское «скунс» (скунс как мех). В польском языке слово «skunks» действительно заимствовано, но фамилия Скунсов нехарактерна для западных регионов — суффикс -ов типичен для великорусской модели, а не для польской (-ski). Если бы предок торговал мехом скунса, его скорее прозвали бы Скунсник или Скунсовский, но не Скунсов.

Географически фамилия встречается крайне редко, преимущественно в центральной России и на Урале. В дореволюционных переписях она почти не фиксируется, что говорит о её позднем возникновении — возможно, в XIX веке, когда в народе уже знали о существовании скунса из-за моды на мех. В таком случае прозвище могли дать за необычную внешность (полосатые волосы, пёстрая одежда) или за резкий запах — хотя последнее звучит грубовато, но в деревенской среде прозвища давали без церемоний.

Таким образом, у фамилии два правдоподобных пути: либо от диалектного «скунс» (скупец) — и это основной вариант, либо от прозвища по животному, но уже в эпоху, когда скунс стал известен в России. В любом случае, носители фамилии Скунсов могут считать, что их предок выделялся либо характером, либо внешностью, и это запомнилось окружающим.