Фамилия Скурыгин образована от прозвища Скурыга, и почти наверняка в её основе лежит украинское слово «скурити» — «выжигать, докуривать до конца (папиросу, трубку)», а также «тратить на изготовление водки, самогона». Такое прозвище могли дать либо заядлому курильщику, который докуривал окурки до последней затяжки, либо человеку, занятому винокурением. Вторая версия выглядит даже правдоподобнее: винокурение было распространённым промыслом на украинских землях, и прозвище по роду занятий легко закреплялось за человеком, а затем переходило к его потомкам.

Есть и иное толкование, связанное со словом «скура» — «шкура, грубая кожа». В этом случае прозвище Скурыга могло указывать на ремесло предка: кожевника, скорняка или торговца кожами. Однако эта версия слабее, поскольку слово «скура» в русских говорах встречается реже, чем глагол «скурити», и не даёт такого естественного прозвищного значения.

Нельзя полностью отбросить и третью версию, по которой прозвище восходит к нарицательному «скуренок» — так в некоторых говорах называли чрезмерно худого, истощённого ребёнка. Но такое значение слишком конкретно и редко, чтобы считать его основным.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Скурыгин — это «сын Скурыги», «тот, кто из рода Скурыги». Модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ с конечным -а: она отвечает на вопрос «чей?» и закрепилась в северных и центральных русских землях, куда прозвище могло прийти вместе с переселенцами с Украины. В конечном счёте, потомок человека по прозвищу Скурыга со временем получил фамилию Скурыгин, и сегодня она сохраняет память о занятии, привычке или внешности далёкого предка.