Фамилия Сквозняков происходит от прозвища Сквозняк. В русском языке слово «сквозняк» имеет два значения: прямое — поток воздуха, проходящий через помещение, и переносное — человек, который «проходит сквозь» толпу или обстоятельства, либо тот, кто вездесущ и не задерживается на месте. Скорее всего, прозвище относилось к подвижному, непоседливому человеку, которого «носит» из дома в дом, или, наоборот, к тому, кто жил в продуваемом доме. В словаре В. Даля слово «сквозняк» также могло означать «проныра», «ловкач», что добавляет возможную характеристику — человек, умеющий проходить сквозь любые преграды.

Основа фамилии — существительное «сквозняк», суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный. Такие фамилии в XV–XVII веках давали крестьянам и посадским людям, реже — служилым. Первые носители могли проживать в северных или центральных губерниях России, где слово «сквозняк» было в ходу. Географически фамилия встречается редко, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от конкретного человека, чьё прозвище закрепилось за родом в одной деревне.

Словообразовательная модель Сквозняков — типичная отпрозвищная фамилия, где суффикс -ов- присоединён к основе на -к. Интересно, что в русском языке есть однокоренные фамилии Сквознов, Сквозников, но Сквозняков — самая редкая и «звуковая», сохранившая уменьшительно-пренебрежительный оттенок исходного прозвища. Это может указывать на то, что прозвище было дано не за профессию, а за черту характера или бытовую особенность.

В отличие от фамилий, образованных от ремёсел (Кузнецов, Плотников), Сквозняков не имеет прямого профессионального корня. Его уникальность — в метафоричности: предок мог быть либо «ветреным» человеком, либо тем, кто живёт на сквозняке. В любом случае, фамилия сохранила бытовую наблюдательность, свойственную русской ономастике.