Фамилия Скытева — женская форма, а мужская, Скытев, встречается редко, что уже настораживает: на слух она кажется искажённой или диалектной. Скорее всего, перед нами не стандартная русская фамилия на -ов/-ев, а вариант написания фамилии Скитев или Скитов.

Если отбросить женский суффикс -а, в основе лежит корень «скыт-» или «скит-». Самое прямое объяснение — от слова «скит»: уединённое жильё монаха-отшельника, небольшой монастырь. В этом случае прозвище Скит (или Скыт) могли дать человеку, который жил при скиту, служил там или сам вёл замкнутый, отшельнический образ жизни.

Однако буква «ы» вместо «и» — неслучайность. В северных и сибирских говорах (особенно в архангельских и вятских) «ы» часто заменяет «и» после твёрдых согласных: «скыт» вместо «скит», «кыслый» вместо «кислый». Поэтому фамилия Скытев — это, вероятно, диалектная фонетическая запись фамилии Скитев. Носитель такой фамилии мог происходить из регионов, где «окали» и «ыкали» — из Поморья, с Урала или из Сибири.

Менее вероятная, но допустимая версия — от тюркского корня. В некоторых тюркских языках «скыт» или «сыкыт» означало «плач», «причитание». Тогда прозвище Скыта могли дать плаксивому или, наоборот, профессиональному плакальщику на похоронах. Но для русской фамилии этот вариант маргинален: суффикс -ев указывает на славянскую модель образования, а не на прямое заимствование основы.

Словообразовательно фамилия проста: основа Скыт- + патронимический суффикс -ев (чей? — сын Скыта). Женская форма Скытева — стандартное указание на принадлежность к роду Скытевых. Встречаемость фамилии крайне низкая, в современных базах она фиксируется единицами, что подтверждает её локальный, диалектный характер. По сути, это редкий осколок севернорусской фонетики, застывший в паспорте.