Фамилия Слепушенко происходит от прозвища Слепуш, которое образовано от прилагательного «слепой». Чаще всего его давали человеку незрячему или с очень плохим зрением. Однако это лишь первый, самый очевидный пласт значения, и он не единственный.

Вторая версия связана с древней традицией давать детям охранительные имена. В народе верили, что имя, означающее физический недостаток, отведёт от младенца настоящую беду. Надеясь вырастить красивого и здорового мальчика, родители сознательно называли его Слепушем, чтобы обмануть злых духов. Такая обережная практика была широко распространена у славян, поэтому прозвище Слепуш могло вовсе не указывать на реальную слепоту, а, наоборот, служить талисманом.

Третья версия, которую лингвисты считают наименее вероятной, возводит основу к нарицательному «слепень» — кровососущему насекомому. В этом случае имя отражало бы старинный обычай нарекать ребёнка по названию животного, чтобы природа воспринимала его как своего и передала ему свои качества. Но здесь форма Слепуш выглядит как излишне ласкательное производное от «слепень», тогда как для прозвища от «слепой» она естественна.

Суффикс «-енко» указывает на украинское происхождение и изначально означал «сын» или «потомок». То есть Слепушенко — буквально «сын Слепуша». Такая модель фамилий массово закрепилась в Левобережной Украине и на юге России, в землях бывшей Гетманщины, в XVII–XVIII веках. Это отличает фамилию от русских фамилий на «-ов/-ев», которые строятся по той же логике, но с другим окончанием.

В написании фамилии встречается вариант Слепущенко с буквой «щ» в середине. Эта форма отражает иное произношение исходного прозвища — Слепущ, которое тоже могло существовать в народной речи. Оба варианта считаются самостоятельными фамилиями, хотя их носители, вероятно, имеют общих предков.

Остаётся добавить, что фамилия редкая и не попала в крупные дореволюционные справочники, поэтому точных сведений о её первых носителях по документам нет. Но словообразовательная модель и семантика основы позволяют уверенно говорить: в основе лежит прозвище, связанное со зрением, — либо реальным недостатком, либо суеверной защитой от него.