Фамилия Смушкова — женская форма фамилии Смушков, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или ремеслом предка-мужчины. Основа здесь — слово «смушка», которое в русских говорах означало шкурку молодого ягнёнка, особенно каракульской породы, или мех из таких шкурок. В словаре Даля «смушка» — это «шкурка с ягненка, смушек», а также «барашек, мерлушка». Таким образом, прозвище Смушок могли дать скорняку, меховщику, торговцу мехом или человеку, который носил шапку или шубу из смушки, выделяясь этим.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «смушк-» добавили патронимический суффикс «-ов», что буквально означает «сын Смушка». Суффикс «-к-» в прозвище указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму, то есть Смушок — не просто «тот, кто работает со смушкой», а скорее «маленький Смух» или «Смушка» (в значении прозвища). Встречается и вариант без суффикса — Смухов, но Смушков звучит более характерно для северных и центральных областей России, где уменьшительные формы прозвищ были в ходу.

Географически фамилия Смушков (и Смушкова) нечастая, но встречается в документах XVII–XVIII веков, особенно в среде посадских людей и крестьян. Например, в переписных книгах по Вятке и Перми Великой можно найти крестьян с прозвищем Смушок, что указывает на промысловый характер занятия: в этих регионах выделка овчин и меховая торговля были распространены. Версия о происхождении от тюркского корня (например, от «смуглый» или «смурый») маловероятна, так как слово «смушка» имеет чёткую славянскую этимологию и связано с «смурый» (тёмно-серый) — по цвету шкурки.

Сейчас носительницы фамилии Смушкова могут жить в разных регионах, но корни стоит искать в среде ремесленников-скорняков или крестьян, занимавшихся меховым промыслом. Фамилия недворянская, не распространённая в высших сословиях, что подтверждает её «профессиональное» происхождение.