Фамилия Софлин — редкий пример, где суффикс -ин указывает не на отчество от крестильного имени, а на профессиональное прозвище. В русской модели фамилий суффикс -ин обычно присоединяют к основам на -а/-я (сын Кузьмы — Кузьмин), но в случае с Софлиным основа — это, скорее всего, прозвище Софля. Искать здесь корень «соф» (как в имени Софья) ошибочно: ударение в фамилии падает на первый слог, а имя Софья дало бы форму Софьин или Софин.

Прозвище Софля восходит к слову «софель» — так в русских говорах называли сапожное шило. Сапожники, шорники и кожевники пользовались софлем для грубых работ: им прокалывали толстую кожу, чтобы затем протаскивать дратву. Человек, получивший прозвище Софля, мог быть мастером по сапожному делу или просто обладать острым, колким характером — прозвища нередко переходили с инструмента на человека по внешнему сходству или манере поведения.

В словарях русских говоров (например, в «Словаре русских народных говоров» под редакцией Ф. П. Филина) слово «софель» или «софля» фиксируется именно в значении «шило», причём с севернорусской и сибирской привязкой. Это даёт важную географическую зацепку: фамилия Софлин могла возникнуть в среде поморских или уральских ремесленников, где кожевенное и сапожное дело было распространено. Фамилия не встречается в дворянских родословных — это типично крестьянская или мещанская фамилия, образованная от прозвища по ремеслу.

Интересно, что фамилия Софлин почти не имеет однокоренных «собратьев» в русском ономастиконе. Нет массовых Софловых или Софлевых, что говорит о локальном характере прозвища. Возможно, первоначально фамилия бытовала в одной-двух волостях, а затем разошлась с переселенцами. В современной России Софлины встречаются точечно, чаще всего в Поволжье и на Урале — что косвенно подтверждает ремесленную версию, так как именно там в XIX веке активно работали артели сапожников.

Есть и альтернативное объяснение: в некоторых говорах «софля» означало не только шило, но и сварливого, придирчивого человека (от глагола «софлить» — ворчать, капризничать). Однако эта версия менее надёжна: глагол редок и зафиксирован лишь в нескольких диалектах. Версия с инструментом выглядит убедительнее, потому что прозвища по орудиям труда — массовое явление в русской антропонимии (ср. Топор, Молот, Шило), а прозвища по чертам характера чаще образуются от прилагательных, а не от названий предметов.